Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl53Q9D1H8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms