Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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