Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stx17Q9D0I4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx17Q9D0I4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms