Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms