Protein–RNA interactions for Protein: Q9D099

Acer3, Alkaline ceramidase 3, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acer3Q9D099 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acer3Q9D099 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms