Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mms19Q9D071 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mms19Q9D071 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mms19Q9D071 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mms19Q9D071 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mms19Q9D071 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mms19Q9D071 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mms19Q9D071 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mms19Q9D071 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mms19Q9D071 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mms19Q9D071 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms