Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms