Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Elp3Q9CZX0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elp3Q9CZX0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms