Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZR4

Cmtm8, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm8Q9CZR4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm8Q9CZR4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms