Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp11Q9CZJ1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Utp11Q9CZJ1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp11Q9CZJ1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp11Q9CZJ1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp11Q9CZJ1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp11Q9CZJ1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp11Q9CZJ1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp11Q9CZJ1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp11Q9CZJ1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp11Q9CZJ1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp11Q9CZJ1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp11Q9CZJ1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp11Q9CZJ1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms