Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp23Q9CX11 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms