Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms