Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prkrip1Q9CWV6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms