Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot11Q9CWN7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms