Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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