Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Sycp2Q9CUU3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms