Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms