Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930535I16RikQ9CUI2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms