Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms