Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms