Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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