Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms