Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms