Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQM1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQM1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQM1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQM1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQM1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQM1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQM1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQM1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQM1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQM1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQM1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQM1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQM1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQM1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQM1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms