Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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