Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ39

Med21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med21Q9CQ39 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med21Q9CQ39 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med21Q9CQ39 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med21Q9CQ39 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med21Q9CQ39 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med21Q9CQ39 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med21Q9CQ39 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med21Q9CQ39 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med21Q9CQ39 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med21Q9CQ39 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med21Q9CQ39 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med21Q9CQ39 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med21Q9CQ39 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med21Q9CQ39 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med21Q9CQ39 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Med21Q9CQ39 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms