Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole4Q9CQ36 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms