Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Chmp3Q9CQ10 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms