Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Rpl17Q9CPR4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Rpl17Q9CPR4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rpl17Q9CPR4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl17Q9CPR4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl17Q9CPR4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl17Q9CPR4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl17Q9CPR4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl17Q9CPR4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl17Q9CPR4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl17Q9CPR4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl17Q9CPR4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl17Q9CPR4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl17Q9CPR4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl17Q9CPR4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl17Q9CPR4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl17Q9CPR4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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