Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcl11bQ99PV8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms