Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI4

Lpin3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpin3Q99PI4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lpin3Q99PI4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lpin3Q99PI4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lpin3Q99PI4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lpin3Q99PI4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lpin3Q99PI4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms