Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GpnmbQ99P91 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms