Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Bco2Q99NF1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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