Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ubqln4Q99NB8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ubqln4Q99NB8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ubqln4Q99NB8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ubqln4Q99NB8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ubqln4Q99NB8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ubqln4Q99NB8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ubqln4Q99NB8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ubqln4Q99NB8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ubqln4Q99NB8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ubqln4Q99NB8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ubqln4Q99NB8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ubqln4Q99NB8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ubqln4Q99NB8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ubqln4Q99NB8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubqln4Q99NB8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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