Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Tdrd1Q99MV1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Tdrd1Q99MV1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Tdrd1Q99MV1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Tdrd1Q99MV1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd1Q99MV1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Tdrd1Q99MV1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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Tdrd1Q99MV1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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