Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprtQ99M80 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprtQ99M80 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
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