Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU8

Uncharacterized protein C6orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99LU8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99LU8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99LU8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99LU8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99LU8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99LU8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99LU8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99LU8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99LU8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99LU8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99LU8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99LU8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99LU8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99LU8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99LU8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99LU8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99LU8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99LU8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q99LU8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q99LU8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99LU8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99LU8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99LU8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99LU8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99LU8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99LU8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99LU8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99LU8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99LU8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99LU8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99LU8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99LU8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99LU8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99LU8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99LU8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99LU8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99LU8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99LU8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99LU8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q99LU8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q99LU8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99LU8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99LU8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99LU8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q99LU8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms