Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms