Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Sh3bp5lQ99LH9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Sh3bp5lQ99LH9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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