Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms