Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp16Q99LG0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms