Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nmd3Q99L48 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms