Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms