Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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