Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab28Q99KL7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms