Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps4Q99KG7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps4Q99KG7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps4Q99KG7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps4Q99KG7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps4Q99KG7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps4Q99KG7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps4Q99KG7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps4Q99KG7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps4Q99KG7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps4Q99KG7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps4Q99KG7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps4Q99KG7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps4Q99KG7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps4Q99KG7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps4Q99KG7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps4Q99KG7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hps4Q99KG7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms