Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms