Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlgn1Q99K10 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms