Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GatbQ99JT1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms