Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Spef1Q99JL1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Spef1Q99JL1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spef1Q99JL1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Spef1Q99JL1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Spef1Q99JL1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms